งานบริหารงานทั่วไป

• หน่วยธุรการและสารบรรณ
• หน่วยการเงินและบัญชี
• หน่วยพัสดุ
• หน่วยบุคลากร
• หน่วยนโยบายและแผน
• หน่วยประกันคุณภาพ
• หน่วยงานประชาสัมพันธ์
• หน่วยสารสนเทศ

งานวิชาการและงานวิจัย

• หน่วยวิจัยและห้องปฏิบัติการ
• หน่วยฝึกอบรมและบริการวิชาการ
• หน่วยส่งเสริมและเผยแพร่ศิลปวัฒนธรรม

งานจัดแสดงและหารายได้

• หน่วยพิพิธภัณฑ์สัตว์น้ำ
• หน่วยสวนนก
• หน่วยแสดงความสามารถสัตว์
• หน่วยสัตว์ทะเลหายาก
• หน่วยจัดหารายได้